Jednostki naukowe

1. Zakład Agrometeorologii i Zastosowań Informatyki (NAI)
2. Zakład Biochemii i Jakości Plonów (NBP)
3. Zakład Biogospodarki i Analiz Systemowych (NBAS)
4. Zakład Gleboznawstwa Erozji i Ochrony Gruntów (NGO)
5. Zakład Herbologii i Technik Uprawy Roli we Wrocławiu (NHT)
6. Zakład Hodowli i Biotechnologii Roślin w Puławach (NHB)
7. Zakład Mikrobiologi Rolniczej w Puławach (NMR)
8. Zakład Systemów i Ekonomiki Produkcji Roślinnej w Puławach (NSE)
9. Zakład Uprawy Roślin Pastewnych w Puławach (NUP)
10. Zakład Uprawy Roślin Zbożowych w Puławach (NUZ)
11. Zakład Żywienia Roślin i Nawożenia w Puławach (NŻN)

Działy obsługi

1. Archiwum Zakładowe (AZ)
2. Dział Finansowo – Księgowy (DFK)
3. Dział Upowszechniania i Wydawnictw (DUW)
4. Dział Wspomagania Badań (DWB)
5. Dział Zamówień Publicznych w Puławach (DZP)
6. Główne Laboratorium Analiz Chemicznych (GLACH)
7. Ośrodek Sieci Komputerowej PULMAN w Puławach (OSK)
   
8. Sekretariat Dyrekcji (SD)
9. Stanowisko d/s kadr  (SKA)
10. Sekretariat Naukowy (SN)
11. DZIAŁ ADMINISTRACYJNO-GOSPODARCZY (DAG)
12. Dział Inwestycyjno – Remontowy (DIR)

Rolnicze Zakłady Doświadczalne (RDZ)

1. RZD Baborówko
2. RZD Błonie-Topola
3. RZD Borusowa
4. RZD Grabów
5. RZD Kępa-Puławy
6. RZD „JASTKÓW” Spółka z o.o. 
7. RZD Werbkowice
8. RZD Wielichowo
9. RZD Wierzbno
10. RZD Żelisławki